知臨集團宣布發表其 PathsDx 技術的合作論文——PathsDx 技術是一種快速周轉的低深度無偏倚宏基因組學測序工作流程,可在 Illumina 平台上進行液體活檢診斷傳染病

NEW YORK & LONDON & PARIS--()--知臨集團有限公司(納斯達克股票代碼:APM,巴黎泛歐證券交易所股票代碼:APM)是一家臨床階段的生物製藥公司,致力於解決腫瘤學、自身免疫性疾病和傳染病領域未滿足的醫療需求。知臨集團很高興地宣布其最新聯合發布了一篇論文,評估Illumina 平台上的快速周轉低深度無偏倚宏基因組測序工作流程。該項名為 PathsDx Test 的技術被證明對傳染病的診斷具有穩健性、快速性和敏感性。

論文題為“Towards a rapid-turnaround low-depth unbiased metagenomics sequencing workflow on the Illumina platforms”,已在線發表於Medrxiv,可從以下網址下載:https://medrxiv.org/cgi/content/short/2023.01.02.22283504v1

知臨集團有限公司首席醫療官鄭子俊醫生評論說:「我們很高興地宣布 PathsDx 在傳染病診斷方面的卓越表現。 迄今為止,PathsDx 測試的靈敏度和特異性均達到 95% 以上。 我們的臨床驗證也表明,至少 93% 的血漿樣本與臨床診斷護理標準測試結果一致(相比而言,業內已報導的液體活檢測試結果為 92.9%1)。 作為臨床驗證的初始階段,這些結果可以說是相當卓越的。 其餘的 7% 屬於基因組非常小 (5kb) 的病毒,是整個基因組行業的共同挑戰。目前我們有一項工作流程開發計劃來努力檢測這些小基因組病毒,以最終達到接近完全一致的目標。 到目前為止,我們驗證結果的趨勢還表明,在臨床驗證樣本增加後,我們的驗證統計數據(包括與病例診斷標準的一致性比較)得到進一步改進。我們評估了需時19 小時的iSeq 100 雙末端測序、更具臨床可接受性的模擬 iSeq 100 截短測序、以及快速 7 小時 MiniSeq 測序平台等不同測序時間對結果的影響。 重要的是,我們的評估結果證明了低深度測序檢測 DNA 和 RNA 病原體的能力。 綜上所述, 已表明iSeq 100 和 MiniSeq 平台與 PathsDx 測試工作流程及其文庫製備試劑盒無偏倚低深度宏基因組學鑑定的兼容性,並且可以根據所需的周轉時間進行選擇。 我們也很高興現時已經建立了一個包含近 20,000 個物種的病原體基因組數據庫,以支持我們的軟件分析,在無偏倚的宏基因組基礎上識別患者樣本中的病原體成分。 憑藉這些顯著的成果,我們正在積極擴大我們在新加坡、香港和美國的驗證站點。 我們還要對 Illumina為支持該項目所做的知識性、機械性和技術性投入表示衷心的感謝。」

參考

1. https://kariusdx.com/karius-test/clinical-and-analytical-validation

關於知臨的 PathsDx 項目

PathsDx Test(先前稱為「RPIDD」)是一種創新的液體活檢驅動的快速病原體分子診斷技術。 PathsDx Test 通過專有的以及受專利保護技術的開發,旨在通過下一代測序平台和基於人工智能的專有軟件,利用患者血液樣本經濟高效地富集致病 DNA 和 RNA 以進行致病基因組測序分析。分析的目標是通過其基因組序列快速而無偏倚地識別和檢測任何外來病原體(病毒、細菌、真菌、寄生蟲),並識別其他未知病原體和新突變的病原體。 PathsDx Test 由兩個專有的宏基因組學下一代測序 (mNGS) 組件組成:(i) HostEL,用於去除宿主背景以豐富病原體 DNA 和 RNA; (ii) AmpRE 用於一步 DNA/RNA 文庫製備,可實現總體成本效益的擴增。 PathsDx 測試已在並將繼續在人類臨床樣本中驗證,到目前為止,此類測試已被證實能夠以公正的方式檢測病原體——包括細菌、真菌以及 DNA 或者RNA 病毒。

關於知臨集團

知臨集團有限公司(納斯達克股票代碼:APM,巴黎泛歐證券交易所股票代碼:APM)是一家臨床階段的生物製藥公司,致力於發現、開發和商業化治療資產,以治療未滿足醫療需求的疾病,特別是腫瘤(包括孤兒腫瘤學適應症)、自身免疫和傳染性疾病。知臨已完成其 ALS-4 (MRSA) 和孤兒藥物 SACT-1(神經母細胞瘤)小分子藥物的兩項 I 期臨床試驗,並將其營養保健品(更年期) NLS-2 NativusWell®商業化。知臨的管線還通過 (i) 建立藥物發現平台,通過例如對已獲批藥物分子的系統篩選,以及基於微生物組的代謝性疾病治療研究平台; (ii) 與新加坡科學、技術和研究機構共同開發和持續臨床驗證其基於分子的新型快速病原體鑑定和檢測診斷技術。

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